A partir du 1er janvier 2016, la gestion des CREPS est transférée aux régions : patrimoine immobilier, entretien général et technique, hébergement, accueil. Selon le ministère de la ville et des sports « ce transfert de compétence sera compensé financièrement de façon intégrale, concomitante et garantie conformément à la Constitution ».
Même si l’on avance que « Ces établissements pourront désormais exercer, en plus des missions nationales, des missions à la demande des régions dans les domaines du sport, de la jeunesse et de l’éducation populaire », on peut toutefois se demander si les compensations financières seront inscrites de façon pérenne.